厦门大学审计处成立于1985年8月，是学校负责内部审计工作的职能部门，在学校主要领导和厦门大学审计委员会的领导下开展工作。

厦门大学审计委员会成立于2020年6月，下设办公室，办公室主任由审计处处长兼任。审计委员会主要负责部署内部审计工作，审议年度审计工作报告，研究制定内部审计改革方案、重大政策和发展战略，审议决策内部审计重大事项等。

厦门大学审计处依照《中华人民共和国审计法》《审计署关于内部审计工作的规定》《教育系统内部审计工作规定》等审计法律法规以及《厦门大学内部审计工作规定》等学校规章，对学校及所属单位财政财务收支、经济活动、内部控制、风险管理实施独立、客观的监督、评价和建议，以促进学校完善治理、实现目标。